1995年10月，国家教委正式批准在厦门大学成立“海洋生态环境国家教委开放研究实验室”，标志着该实验室的正式设立与启动运行。该实验室于1995年10月经国家教委批准成立，依托厦门大学海洋学科与环境学科的雄厚基础，旨在开展亚热带近海生物地球化学过程、机制及其生态和环境效应的基础理论和应用基础研究，为近海及海岸带经济发展、资源开发利用和生态环境保护提供科学依据和技术服务。