2005年1月8日，“近海海洋环境科学国家重点实验室（厦门大学）”（MEL）建设计划论证会在厦门大学顺利召开，标志着该实验室正式进入实质性建设阶段。

会议由科技部基础司基地建设处副处长张延东主持，科技部基础司副司长腾绵震率专家组一行莅临指导，教育部科技司基础处处长李渝红、厦门市科技局副局长徐平东及厦门大学校长朱崇实、副校长孙世刚等领导出席开幕式。论证会专家组由9名国内知名专家组成，包括北京大学的唐孝炎院士、中国科学院海洋研究所的胡敦欣院士等。

经充分质询和讨论，专家组一致认为该实验室在海洋生物地球化学过程及其生态与环境效应研究方面具有长期的学科积累和良好的研究基础，所提出的科研平台建设计划、运行机制建设计划目标明确、内容具体、操作性强，建议科技部批准实施。此次论证会的成功召开，为实验室于2005年3月22日正式获科技部批准建设奠定了坚实基础。