2005年12月28日，“近海海洋环境科学国家重点实验室（厦门大学）”揭牌仪式在厦门大学颂恩楼215室隆重举行，标志着该实验室经过近一年建设后正式向社会开放运行。

揭牌仪式由校长助理庄宗明主持，科技部基础司副司长滕绵震与厦门大学校长朱崇实共同为实验室揭牌。中国科学院院士胡敦欣、黄荣辉、黄本立、田中群，中国工程院院士林鹏，教育部科技司副司长雷朝滋，国家自然科学基金委地学部副主任陆则慰，国家海洋局科技司助理巡视员黄振宗，福建省科技厅副厅长符卫国，福建省教育厅副厅长薛卫民，福建省海洋与渔业局副局长刘修德，厦门市人民政府副市长潘世建等领导出席仪式。

朱崇实校长在致辞中回顾了厦门大学开展海洋科学教育和科研的历程，指出该实验室的揭牌是学校海洋学科实现跨越式发展的新起点。实验室主任洪华生教授介绍了实验室的基本概况。该实验室于2005年3月22日获科技部批准建设，与同济大学的海洋地质国家重点实验室共同成为海洋科学领域的首批国家重点实验室。实验室瞄准全球变化有关的重大科学问题和国家对海洋环境保护与生态安全的重大需求，主攻海洋生物地球化学过程及其与海洋生态系统相互作用。